簡(jiǎn)要描述:STR檢測服務(wù):短串聯(lián)重復序列 (short tandem repeat , STR) ,也稱(chēng)微衛星 DNA(microsalite DNA) ,由于其能提供大量的遺傳標記,因此被認為是繼限制性片段長(cháng)度多態(tài)性 (RFLP) 之后的第二代遺傳標記,STR分析已廣泛應用于遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等諸多領(lǐng)域。高度多態(tài)的微衛星還可以用來(lái)在人群進(jìn)行個(gè)體識別。
微衛星(STR)檢測
STR檢測服務(wù)STR原理:
短串聯(lián)重復序列(short tandem repeat, STR),也稱(chēng)微衛星 DNA(microsalite DNA) ,是由2 - 6個(gè)堿基對作為核心單位,串聯(lián)重復形成的一類(lèi)DNA序列,由于核心單位重復數目在個(gè)體間呈高度變異性并且數量豐富,構成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。它分布于人類(lèi)整個(gè)基因組,平均每15 kb就存在一個(gè)STR基因座。人類(lèi)基因組內已發(fā)現了七千個(gè)以上的STR位點(diǎn)。它具有分布廣泛,易于檢測,信息量大,有高度多態(tài)性并遵循孟德?tīng)柟诧@性遺傳等優(yōu)點(diǎn)。是繼限制性片段長(cháng)度多態(tài)性 (RFLP) 之后的第二代遺傳記,目前STR分析已廣泛應用于遺傳制圖、連鎖性分析、法醫學(xué)鑒定、疾病基因定位、物種多態(tài)性和遺傳病的診斷等諸多領(lǐng)域。
STR檢測服務(wù)流程:
1. 客戶(hù)提供
A.如果提供基因組DNA:至少提供100 ng DNA樣品(針對每個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),需樣品3-5 ul,濃度為30 - 50 ng/ul)。
B.如果提供PCR產(chǎn)物:產(chǎn)物要通過(guò)預實(shí)驗的電泳檢測,特異性要好。
C.如果需要設計引物,請提供目的片段序列或者微衛星檢測位點(diǎn),引物設計好后需要客戶(hù)確認。
D.除提供樣品類(lèi)型,DNA濃度和純度值外,還需要注明可能殘留的抑制劑成分。樣品溶解在ddH2O中,如果不是,請注明溶解液成分。
2. 確定STR位點(diǎn),設計實(shí)驗方案,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記,熒光分子量?jì)葮说倪x用等。
3. 按照所設計的實(shí)驗方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測結果;若PCR產(chǎn)物特異性不夠,將進(jìn)行優(yōu)化。
4. PCR產(chǎn)物通過(guò)ABI 3730XL 測序儀器進(jìn)行毛細管電泳檢測,獲得擴增片段大小的數據。
5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數據進(jìn)行處理分析,將產(chǎn)物片段大小、數量多少的信息轉化成直觀(guān)準確的波形圖譜,為下一步進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數據。
6.發(fā)送準確的微衛星(STR)分型結果報告及PCR產(chǎn)物。