簡(jiǎn)要描述:熒光定量PCR技術(shù)于1996年由美國Applied Biosystems公司推出,由于該技術(shù)不僅實(shí)現了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規PCR相比,它具有特異性更強、有效解決PCR污染問(wèn)題、自動(dòng)化程度高等特點(diǎn),目前已得到廣泛應用;實(shí)時(shí)熒光定量PCR:在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監測整個(gè)PCR進(jìn)程,Z后通過(guò)標準曲線(xiàn)對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real Time Quantitative PCR)
在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監測整個(gè)PCR進(jìn)程,zui后通過(guò)標準曲線(xiàn)對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。
相對定量應用(Relative Quantification,RQ)
特異性熒光標記:
TaqMan法
TaqMan探針的特性:
(1)5′端標記有報告基團(Reporter, R),如FAM、VIC等
(2)3′端標記有熒光淬滅基團 (Quencher, Q)
(3)探針完整,R所發(fā)射的熒光能量被Q基團吸收 ,無(wú)熒光, R與Q分開(kāi),發(fā)熒光
(4)Taq酶有 5′→3′外切核酸酶活性,可水解探針
相對定量通過(guò)內標定量:
內標(Endogenous Control)通常是β-actin、GAPDH基因等看家基因,在細胞中的表達量或在基因組中的拷貝數恒定,受環(huán)境因素影響小,內標定量結果代表了樣本中所含細胞或基因組數量。
相對定量分析方法 :
2-ΔΔCt
前提:目標序列和內參序列的擴增效率接近100%且偏差在5%以?xún)?br /> 1、用內參基因的CT值歸一目標基因的CT值:
ΔCT(test)= CT(target,test)-CT(ref,test)
ΔCT(calibrator)= CT(target,calibrator)-CT(ref, calibrator)
2、用校準樣本的ΔCT值歸一試驗樣本的ΔCT值:
ΔΔCT= ΔCT(test) - ΔCT(calibrator)
3、計算表達水平比率:
2 –ΔΔCT=表達量的比值
服務(wù)流程:
步驟 | 客 戶(hù) 提 供 | 服 務(wù) 內 容 | 基 屹 提 供 |
1 | 新鮮的且盡量多的材料;已知的全長(cháng)基因序列;盡可能詳細的背景資料:DNA/ RNA來(lái)源、豐度等。 | DNA/RNA提取,根據基因序列設計特異性的引物和熒光探針。 | |
2 | 純化好的DNA/RNA(大于5 ug/樣品);已知的全長(cháng)基因序列;盡可能詳細的背景資料:DNA/ RNA來(lái)源、豐度等。 | 根據基因序列設計特異性的引物和熒光探針。 | |
3 | 以DNA為模板,對目的基因進(jìn)行熒光定量PCR檢測分析 | 提供完整的定量分析結果、實(shí)驗熒光定量擴增曲線(xiàn)及詳細的實(shí)驗步驟。 |
注意:客戶(hù)可根據所能提供的起始材料不同,選擇從步驟1或2啟動(dòng)項目。